ChiPlot

ChiPlot是什么？

ChiPlot是一个在线生物信息学绘图与分析平台，免安装、跨平台使用，支持系统发育树、基因组可视化、富集分析、PCA/PCoA/NMDS、多组学网络图、热图等多类型科研级可视化，并提供 Mantel test、共现网络、CCA、RDA 等多种数据分析方法，快速生成符合期刊出版标准的高清图表，适用于科研论文、课题分析与教学展示。

核心定位

• 生信绘图工具集：覆盖系统发育树、基因组可视化、富集分析、网络分析、统计绘图等
• 可视化+分析：不仅画图，还提供 Mantel test、共现网络计算、PCA/PCoA/NMDS 等多种分析方法
• 科研友好：输出符合学术出版标准的高清图片

主要功能模块 

• 进化树绘制：系统发育树（普通/圆形/无根）
• 基因组可视化：基因簇图、保守结构域图、基因组圈图、共线性图
• 组学分析可视化：火山图、KEGG/GO 富集图（含圆形版本）、PCoA、PCA、NMDS、CCA、RDA
• 网络与关系图：微生物共现网络、动态网络图、Sankey 桑基图
• 统计绘图：散点图、折线图、柱状图、箱线图、小提琴图、玫瑰图、热图等
• 地图与布局：地图可视化、峰峦图、云雨图等特殊类型图表 

适用场景

• 科研论文作图：输出符合 SCI 期刊标准的高质量图表
• 课题数据分析：快速验证数据趋势和显著性
• 多组学综合展示：整合基因组、转录组、代谢组等数据
• 课堂与科普演示：直观呈现复杂数据关系

ChiPlot官网及使用教程

官网网址：https://www.chiplot.online/

1. 打开平台并登录：访问ChiPlot官网，直接进入功能页面即可开始使用，大部分模块免注册（保存项目或云端协作时需登录）。

2. 选择绘图/分析模块：ChiPlot按功能类别提供多个模块，首页菜单可直接点击进入：进化树绘制、基因组可视化、组学分析、多维分析、网络与关系图、统计与常规绘图、地图与特殊可视化。

3. 上传数据：点击进入所需功能模块 → 按提示上传数据文件（一般支持 .csv / .txt / .xlsx 等），不同功能的模板数据可在页面 Video Tutorial 或示例下载获取，建议提前整理好字段格式与示例一致，以免导入报错。

4. 设置绘图参数

• 数据映射：选择 X/Y 轴变量、分组因子、颜色标签等
• 样式调整：线型、点型、颜色渐变、字体、图例位置
• 图表细化：显著性标注、误差线、排序方式、注释等

5. 生成与预览：点击 Run / Plot / Generate 按钮生成图表，可多次调整参数并即时预览效果，视频教程按钮可帮助快速熟悉操作。

6. 导出结果：支持 PNG、SVG、PDF 等高分辨率格式，可满足科研论文投稿的 DPI 要求（一般 ≥300dpi）。